Un sector de la organización apuesta por la participación en Ahora Madrid, el partido instrumental creado tras el acuerdo de Ganemos y Podemos para presentarse al consistorio de la capital. Sin embargo, otro sector liderado por la dirección regional prefería mantener las siglas de IU y no diluirse en la confluencia. Esto hizo que la dirección federal aprobara una resolución en la que instaba a la celebración de un referéndum para resolver el conflicto. Esta consulta a las bases no solucionó la situación, ya que al no haber consenso, cada corriente actuó por su parte y se promovieron dos referéndums independientes. El organizado sector encabezado por Valiente abogó por una participación en Ahora Madrid; mientras que el convocado por la dirección regional concluyó con un 89,3% de los sufragios en contra de participar en esta candidatura.
Tras esta consulta, la dirección de IU Madrid confeccionó su candidatura y eligió a la concejal Raquel López para encabezarla. Sin embargo, la Presidencia de IU Federal aprobó el 29 de marzo un nuevo documento (21 votos a favor, 17 en contra y 4 abstenciones) en el que manifestaba que esta lista no tenía el "respaldo" de la dirección federal. Tras las palabras de Barrena parece ser que la candidatura de López es segura.